Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DffaO54786 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DffaO54786 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DffaO54786 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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