Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srpk2O54781 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms