Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp1baO35930 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms