Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfibp2O35711 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms