Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms