Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn6O35646 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms