Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag2O35638 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag2O35638 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag2O35638 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag2O35638 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag2O35638 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms