Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npc1O35604 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms