Protein–RNA interactions for Protein: O35601

Fyb1, FYN-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyb1O35601 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fyb1O35601 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fyb1O35601 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms