Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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