Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms