Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkd2O35245 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms