Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms