Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms