Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Smad6O35182 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms