Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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