Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SdcbpO08992 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SdcbpO08992 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms