Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EllO08856 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EllO08856 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EllO08856 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EllO08856 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EllO08856 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EllO08856 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms