Protein–RNA interactions for Protein: O08852

Pkd1, Polycystin-1, mousemouse

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Length 4,293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1O08852 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pkd1O08852 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pkd1O08852 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkd1O08852 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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