Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gfra2O08842 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms