Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms