Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClockO08785 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClockO08785 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClockO08785 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ClockO08785 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClockO08785 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms