Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MttpO08601 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MttpO08601 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MttpO08601 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MttpO08601 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms