Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20878L7N244 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20878L7N244 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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