Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r78K7N6U5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r78K7N6U5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms