Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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