Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms