Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms