Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20918J3QN17 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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