Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21866J3QMH4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21866J3QMH4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms