Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms