Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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