Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms