Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms