Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer4cG3UXD1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms