Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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