Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5160F8VPN3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms