Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh9F8VPK8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms