Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms