Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp946F6VWU8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp946F6VWU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms