Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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