Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC067074F6RXI4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms