Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms