Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms