Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms