Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd35E9Q9D8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd35E9Q9D8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms