Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

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Length 4,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Dnah11E9Q7N9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms