Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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