Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc71lE9Q4T4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc71lE9Q4T4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc71lE9Q4T4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc71lE9Q4T4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc71lE9Q4T4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccdc71lE9Q4T4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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