Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms